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不过，三代火影敏锐地察觉到，二人背着自己研究柱间细胞，其目的必定不会简单。
只不过，为了自己的私心（大蛇丸是三代火影最喜爱的弟子，三代火影内心中不希望同大蛇丸撕破脸皮，因此，三代火影一直在给大蛇丸弃暗投明的机会）和村子的稳定，三代火影没有选择和大蛇丸、和志村团藏翻脸，恰恰相反，三代火影有意无意地暗中纵容着二人的合作。
不过，这种纵容，终究还是令大蛇丸和志村团藏付出了一定的代价：
“根”部的职权受到了限制和削弱；大蛇丸继承火影之位的可能彻底破灭了。
“哼。”听到三代火影不留情面的反驳后，志村团藏轻哼一声，不再说话。
说什么“木叶从不先发制人”，一个月前“刺杀西瓜山河豚鬼三人”的计划又作何解释？
看了一眼三代火影虚伪的面容，志村团藏对三代火影的厌恶感又加深了一层。
三代火影和志村团藏都是二代火影的得意弟子，不过，在性格上，二人有着天壤之别。
三代火影，往好了说，叫智谋过人，往坏了说，就是表里不一、富有心机。
表面上，三代火影是一个和蔼可亲的老爷爷，一个爱好和平的“鸽派”。然而，在三代火影和蔼的外表下，隐藏着他不为人知的黑暗一面。
孤立宇智波一族、排挤日向一族、散发谣言逼死旗木朔茂……
三代火影做的坏事不少，然而，这些坏事，却很少被外人提及。
似乎，在全体木叶村民的心中，三代火影就是一个毫无污点的“完人”。
不过，聪明人往往可以看出，三代火影的正面形象，不过是依靠一些政治手段日积月累塑造出来的。
“你是木叶沐浴阳光的叶，我是深扎地下隐藏黑暗之中的根。”
团藏的这一句话，极其恰当地反映出二人的真实关系，以及三代火影为什么总是以正面形象面对大众。
木叶需要一个偶像，让大家去崇拜，为大家树立榜样。
这个偶像，必须是一个内心充满阳光、人生没有污点、拥有博爱之心的人。
作为火影，没有人比三代火影更适合去扮演这个偶像了。
那么，问题来了。
火影的职位会经常迫使三代火影做一些见不得人的事情，而这些事情，无疑会损坏三代火影好不容易塑造起来的伟岸的形象。
那么，三代火影又是怎么平衡二者之间的关系的，又是怎么在行使火影职权的同时保持自己高光伟岸的形象的？
是志村团藏，是志村团藏为三代火影背了黑锅。
既然三代火影不能光明正大的做坏事，而这些坏事，又是三代火影不得不做的事情。那么，何不让志村团藏去代替三代火影下达命令？
在这一点上，三代火影和志村团藏达成了共识。
“根”部的存在，看似多余（木叶已经有了一个暗部，“根”部的一些职能和暗部相重合），实则很有必要。
恰恰是因为有了“根”部，三代火影才能塑造起自己正面的形象。
将好事留给暗部，坏事抛给“根”部。三代火影和志村团藏，暗部和“根”部，一个唱红脸，一个唱白脸，双双支撑起了木叶。
说到这里，可能有人会问了，难道志村团藏会甘心于为三代火影背黑锅，给自己留下一身骂名？
甘心，起码目前为止，志村团藏都十分甘心为三代火影背黑锅。
“根”部的存在，不是单赢，而是双赢。
对于三代火影来说，“根”部帮自己处理了许多自己不方便下达的任务，保护了自己正面的形象不受破坏。
对于志村团藏来说，“根”部的存在，使得自己的权力在木叶村内仅次于三代火影，拥有极高的话语权。
如果没有“根”部，志村团藏或许只是一个没有实力、没有依靠、话语权一般的普通高层。“根”部的存在，保留了志村团藏继承火影之位的可能性，满足了志村团藏隐藏于内心的“权力欲”，使得志村团藏毫无怨言地给三代火影服务。
相比“心机boy”三代火影，一直背黑锅、被观众唾弃的志村团藏就显得可爱和单纯多了。
志村团藏毫不掩饰自己的性格和欲望。事实上，志村团藏也不需要进行掩饰。
无论是志村团藏还是三代火影，为人处世的原则都是木叶不受他人的侵犯。
这也是三代火影和志村团藏被很多人尊敬的原因。
“三代，你的徒弟自来也和纲手都离开村子了。现如今，村子里能够御敌的影级强者，就只剩下你、大蛇丸和旗木朔茂了。”长老团中，转寝小春适时提醒道。
和原著中不同的是，由于宇智波祭的参与，旗木朔茂并未在任务中选择抛弃任务、营救队友。
这也就意味着，旗木朔茂不会像原著中一样，因为同伴的责备、村民的无端责备而走上自杀这条不归路。
众所周知，在火影原著中，由于自来也、纲手、旗木朔茂的相继离去，木叶村在“三战”后期的实力大大削弱。
经过宇智波祭这一“掺和”，旗木朔茂没有死，木叶的实力比原著同期要高不少。对于即将同岩隐村的战争，木叶的胜算似乎要比原著中大了不少。
“这个我知道。”三代火影吐出一口白烟，“自来也和纲手两个孩子不愿意继续留在村子里，就由他们去吧。”
“现如今，大蛇丸正在养伤，我作为火影不能轻易离开村子，能够担负前线抗敌大任的，就只剩下朔茂了。”三代火影皱起了眉头，淡淡地说道。
本来，若是大蛇丸勾结志村团藏研究柱间细胞的事情没有暴露，三代火影是十分愿意将前线指挥官的大任授予大蛇丸的。
从一年前，和云隐村的战争中，大蛇丸被三代火影授予前线总指挥官就能看出三代火影的私心了。
同是“三忍”，实力不逊于大蛇丸的自来也仅仅被授予“副指挥官”的职位。